# Mannschaft Sp. S. U. N. Tore Dif. Pk.
1 SpVgg Bayreuth, Deutschland SpVgg Bayreuth 24 13 7 4 51:27 24 46 1.92
2 Viktoria Aschaffenburg, Deutschland Viktoria Aschaffenburg 23 13 5 5 47:25 22 44 1.91
3 1. FC Schweinfurt 05, Deutschland 1. FC Schweinfurt 05 23 14 2 7 48:29 19 44 1.91
4 1. FC Nürnberg II, Deutschland 1. FC Nürnberg II 23 12 7 4 51:27 24 43 1.87
5 TSV Aubstadt, Deutschland TSV Aubstadt 23 10 6 7 37:35 2 36 1.57
6 VfB Eichstätt, Deutschland VfB Eichstätt 24 10 7 7 43:26 17 37 1.54
7 SpVgg Greuther Fürth II, Deutschland SpVgg Greuther Fürth II 24 10 6 8 30:29 1 36 1.50
8 TSV Buchbach, Deutschland TSV Buchbach 23 9 7 7 31:27 4 34 1.48
9 FC Augsburg II, Deutschland FC Augsburg II 23 8 7 8 40:32 8 31 1.35
10 SV Schalding-Heining, Deutschland SV Schalding-Heining 22 8 5 9 30:43 -13 29 1.32
11 Wacker Burghausen, Deutschland Wacker Burghausen 23 8 5 10 32:32 0 29 1.26
12 FV Illertissen, Deutschland FV Illertissen 23 8 4 11 35:47 -12 28 1.22
13 SV Heimstetten, Deutschland SV Heimstetten 24 8 2 14 43:52 -9 26 1.08
14 TSV 1896 Rain, Deutschland TSV 1896 Rain 23 7 3 13 24:41 -17 24 1.04
15 FC Memmingen, Deutschland FC Memmingen 21 4 8 9 18:29 -11 20 0.95
16 TSV 1860 Rosenheim, Deutschland TSV 1860 Rosenheim 24 6 3 15 30:58 -28 21 0.88
17 VfR Garching, Deutschland VfR Garching 20 3 4 13 21:52 -31 13 0.65
18 Türkgücü München, Deutschland Türkgücü München 0 0 0 0 0:0 0 0
  Playoffs
  Playoffs
  Abstieg

# Im Zuge der Unterbrechung durch die Corona-Epidemie und der späteren Fortführung der Liga hatte der Bayerische Fußball-Verband beschlossen, alle Spiele von Türkgücü München (Aufsteiger in die 3. Liga 2020/2021) aus der Wertung der gesamten Spielzeit zu nehmen.

# Wegen der Coronavirus-Pandemie konnte die Saison nicht zu Ende gespielt werden. Stattdessen wurden Playoffs zwischen Bayreuth, Schweinfurt und Aschaffenburg angesetzt, um den für die Aufstiegsrunde zur 3. Liga berechtigten Verein zu ermittteln.