# Mannschaft Sp. S. U. N. Tore Dif. Pk.
1 Viktoria Aschaffenburg, Deutschland Viktoria Aschaffenburg 25 15 5 5 51:27 24 50 2.00
2 1. FC Nürnberg II, Deutschland 1. FC Nürnberg II 25 14 7 4 61:32 29 49 1.96
3 SpVgg Bayreuth, Deutschland SpVgg Bayreuth 25 14 7 4 53:28 25 49 1.96
4 1. FC Schweinfurt 05, Deutschland 1. FC Schweinfurt 05 23 14 2 7 48:29 19 44 1.91
5 TSV Aubstadt, Deutschland TSV Aubstadt 25 11 6 8 43:41 2 39 1.56
6 VfB Eichstätt, Deutschland VfB Eichstätt 26 10 7 9 46:32 14 37 1.42
7 TSV Buchbach, Deutschland TSV Buchbach 25 9 8 8 32:29 3 35 1.40
8 SpVgg Greuther Fürth II, Deutschland SpVgg Greuther Fürth II 26 10 6 10 31:33 -2 36 1.38
9 FC Augsburg II, Deutschland FC Augsburg II 25 9 7 9 44:35 9 34 1.36
10 SV Schalding-Heining, Deutschland SV Schalding-Heining 24 9 5 10 34:45 -11 32 1.33
11 Wacker Burghausen, Deutschland Wacker Burghausen 25 9 6 10 36:35 1 33 1.32
12 FV Illertissen, Deutschland FV Illertissen 25 9 4 12 37:51 -14 31 1.24
13 TSV 1896 Rain, Deutschland TSV 1896 Rain 25 9 3 13 26:41 -15 30 1.20
14 SV Heimstetten, Deutschland SV Heimstetten 25 8 2 15 44:54 -10 26 1.04
15 FC Memmingen, Deutschland FC Memmingen 22 4 8 10 18:30 -12 20 0.91
16 TSV 1860 Rosenheim, Deutschland TSV 1860 Rosenheim 25 6 3 16 30:61 -31 21 0.84
17 VfR Garching, Deutschland VfR Garching 20 3 4 13 21:52 -31 13 0.65
18 Türkgücü München, Deutschland Türkgücü München 0 0 0 0 0:0 0 0
  Playoffs
  Playoffs
  Abstieg

# Im Zuge der Unterbrechung durch die Corona-Epidemie und der späteren Fortführung der Liga hatte der Bayerische Fußball-Verband beschlossen, alle Spiele von Türkgücü München (Aufsteiger in die 3. Liga 2020/2021) aus der Wertung der gesamten Spielzeit zu nehmen.

# Wegen der Coronavirus-Pandemie konnte die Saison nicht zu Ende gespielt werden. Stattdessen wurden Playoffs zwischen Bayreuth, Schweinfurt und Aschaffenburg angesetzt, um den für die Aufstiegsrunde zur 3. Liga berechtigten Verein zu ermittteln.