# Mannschaft Sp. S. U. N. Tore Dif. Pk.
1 SV Babelsberg 03, Deutschland SV Babelsberg 03 11 7 4 0 14:4 10 25
2 Holstein Kiel, Deutschland Holstein Kiel 11 7 2 2 18:10 8 23
3 Hallescher FC, Deutschland Hallescher FC 11 5 6 0 12:7 5 21
4 1. FC Magdeburg, Deutschland 1. FC Magdeburg 11 6 2 3 14:8 6 20
5 SV Wilhelmshaven, Deutschland SV Wilhelmshaven 11 5 5 1 18:13 5 20
6 VfL Wolfsburg II, Deutschland VfL Wolfsburg II 11 5 2 4 18:11 7 17
7 VFC Plauen, Deutschland VFC Plauen 11 4 5 2 18:12 6 17
8 FC Oberneuland, Deutschland FC Oberneuland 11 5 2 4 11:12 -1 17
9 Altona 93, Deutschland Altona 93 11 5 1 5 20:20 0 16
10 Hamburger SV II, Deutschland Hamburger SV II 11 4 3 4 14:12 2 15
11 Hannover 96 II, Deutschland Hannover 96 II 11 4 2 5 15:14 1 14
12 Hansa Rostock II, Deutschland Hansa Rostock II 11 4 2 5 16:21 -5 14
13 Chemnitzer FC, Deutschland Chemnitzer FC 11 3 3 5 16:15 1 12
14 VfB Lübeck, Deutschland VfB Lübeck 11 2 4 5 12:15 -3 10
15 Sachsen Leipzig, Deutschland Sachsen Leipzig 11 2 4 5 6:13 -7 10
16 Hertha BSC II, Deutschland Hertha BSC II 11 3 1 7 9:22 -13 10
17 Türkiyemspor Berlin, Deutschland Türkiyemspor Berlin 11 2 2 7 9:18 -9 8
18 Energie Cottbus II, Deutschland Energie Cottbus II 11 0 2 9 6:19 -13 2
  Aufstieg
  Abstieg

# Sachsen Leipzig hat am 4. März 2009 einen Insolvenzantrag gestellt. Der Verein steht damit als erster Absteiger aus der Regionalliga Nord fest.

# Altona 93 erhält keine Lizenz für die Saison 2009/2010 und steht damit als Absteiger fest.

# Türkiyemspor Berlin hält trotz Rang 15 die Klasse, da Kickes Emden nach dem Lizenzrückzug für die 3. Liga in der Saison 2009/2010 in der Oberliga startet.