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| 14.03.2009 | 13:30 | Chemnitzer FC | - | Hansa Rostock II | 2:0 (1:0) | |
| 13:30 | Energie Cottbus II | - | Hallescher FC | 0:0 (0:0) | ||
| 14:00 | Altona 93 | - | SV Babelsberg 03 | 1:2 (0:1) | ||
| 14:00 | FC Oberneuland | - | Hannover 96 II | 0:2 (0:0) | ||
| 14:00 | VfB Lübeck | - | VfL Wolfsburg II | 1:1 (1:1) | ||
| 15.03.2009 | 13:30 | 1. FC Magdeburg | - | Hamburger SV II | 2:1 (1:1) | |
| 14:00 | Türkiyemspor Berlin | - | Holstein Kiel | 0:1 (0:0) | ||
| 14:00 | SV Wilhelmshaven | - | Hertha BSC II | 0:2 (0:0) | ||
| 29.04.2009 | 19:00 | Sachsen Leipzig | - | VFC Plauen | 0:3 (0:1) |
| # | Mannschaft | Sp. | S. | U. | N. | Tore | Dif. | Pk. | |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 |
|
Holstein Kiel | 22 | 15 | 5 | 2 | 38:16 | 22 | 50 |
| 2 |
|
Hallescher FC | 22 | 12 | 10 | 0 | 24:8 | 16 | 46 |
| 3 |
|
1. FC Magdeburg | 22 | 13 | 5 | 4 | 33:17 | 16 | 44 |
| 4 |
|
SV Babelsberg 03 | 22 | 11 | 10 | 1 | 28:11 | 17 | 43 |
| 5 |
|
Hannover 96 II | 22 | 10 | 3 | 9 | 32:26 | 6 | 33 |
| 6 |
|
Chemnitzer FC | 22 | 8 | 7 | 7 | 33:24 | 9 | 31 |
| 7 |
|
VfL Wolfsburg II | 22 | 8 | 6 | 8 | 31:22 | 9 | 30 |
| 8 |
|
Hansa Rostock II | 22 | 9 | 3 | 10 | 35:35 | 0 | 30 |
| 9 |
|
SV Wilhelmshaven | 22 | 8 | 6 | 8 | 27:29 | -2 | 30 |
| 10 |
|
FC Oberneuland | 22 | 7 | 6 | 9 | 22:23 | -1 | 27 |
| 11 |
|
VFC Plauen | 22 | 7 | 6 | 9 | 29:33 | -4 | 27 |
| 12 |
|
Hertha BSC II | 22 | 7 | 6 | 9 | 22:33 | -11 | 27 |
| 13 |
|
VfB Lübeck | 22 | 5 | 11 | 6 | 21:21 | 0 | 26 |
| 14 |
|
Türkiyemspor Berlin | 22 | 7 | 3 | 12 | 21:32 | -11 | 24 |
| 15 |
|
Hamburger SV II | 22 | 6 | 5 | 11 | 26:28 | -2 | 23 |
| 16 |
|
Altona 93 | 22 | 6 | 5 | 11 | 26:40 | -14 | 23 |
| 17 |
|
Sachsen Leipzig | 22 | 3 | 7 | 12 | 10:34 | -24 | 16 |
| 18 |
|
Energie Cottbus II | 22 | 1 | 6 | 15 | 13:39 | -26 | 9 |
| Aufstieg | |
| Abstieg |
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# Sachsen Leipzig hat am 4. März 2009 einen Insolvenzantrag gestellt. Der Verein steht damit als erster Absteiger aus der Regionalliga Nord fest. # Altona 93 erhält keine Lizenz für die Saison 2009/2010 und steht damit als Absteiger fest. # Türkiyemspor Berlin hält trotz Rang 15 die Klasse, da Kickes Emden nach dem Lizenzrückzug für die 3. Liga in der Saison 2009/2010 in der Oberliga startet. |
