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| 04.04.2009 | 13:30 | Sachsen Leipzig | - | SV Wilhelmshaven | 3:1 (1:0) | |
| 13:30 | Hallescher FC | - | FC Oberneuland | 1:0 (1:0) | ||
| 05.04.2009 | 14:00 | Hertha BSC II | - | Altona 93 | 4:3 (1:1) | |
| 14:00 | VfL Wolfsburg II | - | Energie Cottbus II | 0:1 (0:0) | ||
| 14:00 | Hamburger SV II | - | Türkiyemspor Berlin | 0:0 (0:0) | ||
| 15:00 | Holstein Kiel | - | Hannover 96 II | 2:0 (0:0) | ||
| 11.04.2009 | 13:30 | SV Babelsberg 03 | - | Chemnitzer FC | 3:1 (2:1) | |
| 14:00 | Hansa Rostock II | - | VfB Lübeck | 1:1 (1:1) | ||
| 12.04.2009 | 14:00 | VFC Plauen | - | 1. FC Magdeburg | 3:4 (2:3) |
| # | Mannschaft | Sp. | S. | U. | N. | Tore | Dif. | Pk. | |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 |
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Holstein Kiel | 25 | 17 | 6 | 2 | 42:17 | 25 | 57 |
| 2 |
|
Hallescher FC | 25 | 14 | 11 | 0 | 29:10 | 19 | 53 |
| 3 |
|
SV Babelsberg 03 | 25 | 13 | 10 | 2 | 32:14 | 18 | 49 |
| 4 |
|
1. FC Magdeburg | 25 | 14 | 5 | 6 | 37:24 | 13 | 47 |
| 5 |
|
VfL Wolfsburg II | 25 | 10 | 6 | 9 | 39:25 | 14 | 36 |
| 6 |
|
Hannover 96 II | 25 | 10 | 5 | 10 | 34:30 | 4 | 35 |
| 7 |
|
Hansa Rostock II | 25 | 10 | 5 | 10 | 40:39 | 1 | 35 |
| 8 |
|
Hertha BSC II | 25 | 9 | 6 | 10 | 27:37 | -10 | 33 |
| 9 |
|
Chemnitzer FC | 25 | 8 | 8 | 9 | 35:29 | 6 | 32 |
| 10 |
|
FC Oberneuland | 25 | 8 | 7 | 10 | 25:25 | 0 | 31 |
| 11 |
|
SV Wilhelmshaven | 25 | 8 | 7 | 10 | 32:39 | -7 | 31 |
| 12 |
|
VfB Lübeck | 25 | 5 | 14 | 6 | 26:26 | 0 | 29 |
| 13 |
|
VFC Plauen | 25 | 7 | 8 | 10 | 37:42 | -5 | 29 |
| 14 |
|
Hamburger SV II | 25 | 7 | 6 | 12 | 29:30 | -1 | 27 |
| 15 |
|
Türkiyemspor Berlin | 25 | 7 | 5 | 13 | 23:35 | -12 | 26 |
| 16 |
|
Altona 93 | 25 | 6 | 5 | 14 | 30:49 | -19 | 23 |
| 17 |
|
Sachsen Leipzig | 25 | 4 | 8 | 13 | 16:39 | -23 | 20 |
| 18 |
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Energie Cottbus II | 25 | 4 | 6 | 15 | 16:39 | -23 | 18 |
| Aufstieg | |
| Abstieg |
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# Sachsen Leipzig hat am 4. März 2009 einen Insolvenzantrag gestellt. Der Verein steht damit als erster Absteiger aus der Regionalliga Nord fest. # Altona 93 erhält keine Lizenz für die Saison 2009/2010 und steht damit als Absteiger fest. # Türkiyemspor Berlin hält trotz Rang 15 die Klasse, da Kickes Emden nach dem Lizenzrückzug für die 3. Liga in der Saison 2009/2010 in der Oberliga startet. |
