Tabelle » Hinrunde Rückrunde
# Mannschaft Sp. S. U. N. Tore Dif. Pk.
1 Holstein Kiel, Deutschland Holstein Kiel 17 11 4 2 28:14 14 37
2 1. FC Magdeburg, Deutschland 1. FC Magdeburg 17 11 3 3 27:12 15 36
3 Hallescher FC, Deutschland Hallescher FC 17 9 8 0 18:8 10 35
4 SV Babelsberg 03, Deutschland SV Babelsberg 03 17 9 7 1 19:7 12 34
5 SV Wilhelmshaven, Deutschland SV Wilhelmshaven 17 8 6 3 27:18 9 30
6 VfL Wolfsburg II, Deutschland VfL Wolfsburg II 17 7 4 6 22:15 7 25
7 Hannover 96 II, Deutschland Hannover 96 II 17 7 3 7 23:21 2 24
8 Hansa Rostock II, Deutschland Hansa Rostock II 17 7 2 8 30:28 2 23
9 FC Oberneuland, Deutschland FC Oberneuland 17 6 4 7 17:18 -1 22
10 VFC Plauen, Deutschland VFC Plauen 17 5 6 6 22:23 -1 21
11 Chemnitzer FC, Deutschland Chemnitzer FC 17 5 5 7 25:23 2 20
12 Türkiyemspor Berlin, Deutschland Türkiyemspor Berlin 17 6 2 9 17:24 -7 20
13 VfB Lübeck, Deutschland VfB Lübeck 17 4 7 6 18:19 -1 19
14 Altona 93, Deutschland Altona 93 17 5 4 8 23:30 -7 19
15 Hamburger SV II, Deutschland Hamburger SV II 17 4 5 8 17:22 -5 17
16 Hertha BSC II, Deutschland Hertha BSC II 17 4 4 9 16:31 -15 16
17 Sachsen Leipzig, Deutschland Sachsen Leipzig 17 2 6 9 8:22 -14 12
18 Energie Cottbus II, Deutschland Energie Cottbus II 17 1 4 12 10:32 -22 7
  Aufstieg
  Abstieg

# Sachsen Leipzig hat am 4. März 2009 einen Insolvenzantrag gestellt. Der Verein steht damit als erster Absteiger aus der Regionalliga Nord fest.

# Altona 93 erhält keine Lizenz für die Saison 2009/2010 und steht damit als Absteiger fest.

# Türkiyemspor Berlin hält trotz Rang 15 die Klasse, da Kickes Emden nach dem Lizenzrückzug für die 3. Liga in der Saison 2009/2010 in der Oberliga startet.