| 12. Spieltag | 02.12.2024 | Madura United | - | Persebaya Surabaya | 1:2 | ||||
| 16. Spieltag | 20.12.2024 | Madura United | - | Bali United | 2:1 |  |
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| 17. Spieltag | 27.12.2024 | PSS Sleman | - | Madura United | 4:0 | ||||
| 18. Spieltag | 10.01.2025 | Malut United FC | - | Madura United | 0:1 | |
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| 19. Spieltag | 18.01.2025 | Madura United | - | PS Barito Putera | 2:4 | ||||
| 24. Spieltag | 22.02.2025 | Persib Bandung | - | Madura United | 0:0 | ||||
| 25. Spieltag | 02.03.2025 | Madura United | - | PSM Makassar | 1:3 | ||||
| 34. Spieltag | 24.05.2025 | Madura United | - | PSS Sleman | 0:3 |
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