| 2. Spieltag | 11.09.2016 | KS Korabi Peshkopi | - | KF Skënderbeu | 0:2 | ||||
| 3. Spieltag | 17.09.2016 | KF Skënderbeu | - | KF Laçi | 1:0 |  |
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| 4. Spieltag | 24.09.2016 | KF Skënderbeu | - | Luftëtari Gjirokastër | 1:0 | ||||
| 5. Spieltag | 01.10.2016 | KF Skënderbeu | - | FK Vllaznia | 3:0 | ||||
| 7. Spieltag | 16.10.2016 | KF Tiranë | - | KF Skënderbeu | 2:1 | |
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| 11. Spieltag | 20.11.2016 | KF Skënderbeu | - | KS Korabi Peshkopi | 1:0 | ||||
| 12. Spieltag | 26.11.2016 | KF Laçi | - | KF Skënderbeu | 0:1 | ||||
| 13. Spieltag | 30.11.2016 | Luftëtari Gjirokastër | - | KF Skënderbeu | 0:0 | |
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| 15. Spieltag | 09.12.2016 | KF Teuta Durrës | - | KF Skënderbeu | 0:0 |
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