| 32. Spieltag | 14.02.2017 | Bury FC | - | Milton Keynes Dons | 0:0 | ||||
| 33. Spieltag | 18.02.2017 | Milton Keynes Dons | - | Fleetwood Town | 0:1 | ||||
| 37. Spieltag | 11.03.2017 | Milton Keynes Dons | - | Rochdale AFC | 2:2 | ||||
| 38. Spieltag | 14.03.2017 | AFC Wimbledon | - | Milton Keynes Dons | 2:0 | ||||
| 44. Spieltag | 17.04.2017 | Southend United | - | Milton Keynes Dons | 1:2 | ||||
| 46. Spieltag | 30.04.2017 | Walsall FC | - | Milton Keynes Dons | 1:4 |
England