| 1. Spieltag | 19.01.2025 | Real España | - | Deportivo Génesis | 1:1 | ||||
| 2. Spieltag | 26.01.2025 | Deportivo Génesis | - | Lobos UPNFM | 4:0 | ||||
| 3. Spieltag | 31.01.2025 | Victoria | - | Deportivo Génesis | 1:0 | ||||
| 4. Spieltag | 03.02.2025 | Deportivo Génesis | - | Motagua | 1:1 | ||||
| 5. Spieltag | 08.02.2025 | Olancho FC | - | Deportivo Génesis | 1:1 |  |
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| 6. Spieltag | 13.02.2025 | Deportivo Génesis | - | Real Sociedad | 1:1 | |
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| 9. Spieltag | 03.03.2025 | Deportivo Génesis | - | Olimpia | 1:1 | ||||
| 12. Spieltag | 30.03.2025 | Deportivo Génesis | - | Victoria | 3:3 | ||||
| 13. Spieltag | 03.04.2025 | Motagua | - | Deportivo Génesis | 4:1 | |
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| 15. Spieltag | 13.04.2025 | Real Sociedad | - | Deportivo Génesis | 1:0 | ||||
| 16. Spieltag | 19.04.2025 | Marathón | - | Deportivo Génesis | 0:0 | |
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| 18. Spieltag | 04.05.2025 | Olimpia | - | Deportivo Génesis | 4:0 |
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