| 2. Spieltag | 06.03.2012 | Universitario de Deportes | - | Cienciano | 1:1 | ||||
| 3. Spieltag | 11.03.2012 | Cienciano | - | León de Huánuco | 2:3 | ||||
| 4. Spieltag | 18.03.2012 | Real Garcilaso | - | Cienciano | 1:0 | ||||
| 6. Spieltag | 01.04.2012 | Universidad Cesar Vallejo | - | Cienciano | 1:0 | ||||
| 7. Spieltag | 08.04.2012 | Cienciano | - | Unión Comercio | 0:0 | ||||
| 8. Spieltag | 15.04.2012 | FBC Melgar | - | Cienciano | 3:0 | ||||
| 9. Spieltag | 22.04.2012 | Cienciano | - | Sport Huancayo | 2:2 |  |
|||
| 10. Spieltag | 29.04.2012 | Alianza Lima | - | Cienciano | 2:1 | ||||
| 11. Spieltag | 03.05.2012 | Cienciano | - | Inti Gas | 1:2 | ||||
| 12. Spieltag | 06.05.2012 | Cienciano | - | José Gálvez | 3:1 | ||||
| 13. Spieltag | 12.05.2012 | Sporting Cristal | - | Cienciano | 4:0 | ||||
| 14. Spieltag | 20.05.2012 | Cienciano | - | Juan Aurich | 0:1 | ||||
| 16. Spieltag | 16.06.2012 | Sport Boys | - | Cienciano | 1:1 | ||||
| 17. Spieltag | 23.06.2012 | Cienciano | - | Universitario de Deportes | 2:3 | ||||
| 18. Spieltag | 27.06.2012 | León de Huánuco | - | Cienciano | 4:1 |
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