| 2. Spieltag | 12.08.2023 | FC Kosova Zürich | - | FC Winterthur II | 0:0 | ||||
| 6. Spieltag | 09.09.2023 | FC Uzwil | - | FC Winterthur II | 0:2 | ||||
| 10. Spieltag | 08.10.2023 | FC Mendrisio | - | FC Winterthur II | 0:0 | ||||
| 13. Spieltag | 05.11.2023 | FC Winterthur II | - | FC Gossau | 3:0 | ||||
| 15. Spieltag | 18.11.2023 | FC Winterthur II | - | FC Wettswil-Bonstetten | 1:2 | ||||
| 16. Spieltag | 25.11.2023 | FC Linth 04 | - | FC Winterthur II | 1:3 | ||||
| 18. Spieltag | 03.03.2024 | Grasshopper Club Zürich II | - | FC Winterthur II | 0:0 |  |
|||
| 20. Spieltag | 16.03.2024 | SV Höngg | - | FC Winterthur II | 1:2 | ||||
| 21. Spieltag | 23.03.2024 | FC Winterthur II | - | FC Uzwil | 4:1 | ||||
| 22. Spieltag | 30.03.2024 | USV Eschen/Mauren | - | FC Winterthur II | 1:0 | ||||
| 24. Spieltag | 13.04.2024 | SC YF/Juventus Zürich | - | FC Winterthur II | 5:1 | ||||
| 25. Spieltag | 20.04.2024 | FC Winterthur II | - | FC Mendrisio | 4:0 |  |
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| 26. Spieltag | 27.04.2024 | AC Taverne | - | FC Winterthur II | 1:0 | ||||
| 27. Spieltag | 04.05.2024 | FC Winterthur II | - | FC Kreuzlingen | 3:2 | ||||
| 28. Spieltag | 12.05.2024 | FC Gossau | - | FC Winterthur II | 4:1 | ||||
| 29. Spieltag | 18.05.2024 | FC Winterthur II | - | FC Balzers | 4:1 | |
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