| 8. Spieltag | 18.10.2024 | PSM Makassar | - | Madura United | 2:0 | ||||
| 12. Spieltag | 02.12.2024 | Madura United | - | Persebaya Surabaya | 1:2 |  |
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| 18. Spieltag | 10.01.2025 | Malut United FC | - | Madura United | 0:1 | ||||
| 19. Spieltag | 18.01.2025 | Madura United | - | PS Barito Putera | 2:4 | ||||
| 20. Spieltag | 24.01.2025 | Persita Tangerang | - | Madura United | 1:1 | ||||
| 21. Spieltag | 01.02.2025 | Madura United | - | Persis Solo (LI) | 2:0 | ||||
| 22. Spieltag | 08.02.2025 | Madura United | - | PSBS Biak | 0:0 | ||||
| 23. Spieltag | 15.02.2025 | Madura United | - | Dewa United FC | 3:1 | ||||
| 24. Spieltag | 22.02.2025 | Persib Bandung | - | Madura United | 0:0 | ||||
| 25. Spieltag | 02.03.2025 | Madura United | - | PSM Makassar | 1:3 | ||||
| 26. Spieltag | 16.03.2025 | PSIS Semarang | - | Madura United | 1:2 | ||||
| 29. Spieltag | 20.04.2025 | Persebaya Surabaya | - | Madura United | 1:0 | |
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| 31. Spieltag | 04.05.2025 | Semen Padang | - | Madura United | 2:1 | ||||
| 32. Spieltag | 10.05.2025 | Madura United | - | Borneo FC | 2:3 | |
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| 33. Spieltag | 17.05.2025 | Bali United | - | Madura United | 0:2 | ||||
| 34. Spieltag | 24.05.2025 | Madura United | - | PSS Sleman | 0:3 |
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