| 3. Spieltag | 21.08.2016 | FK Pobeda Junior | - | Vardar Skopje | 0:1 |  |
|||
| 4. Spieltag | 27.08.2016 | Vardar Skopje | - | FK Bregalnica Štip | 5:1 | ||||
| 5. Spieltag | 11.09.2016 | Makedonija GP | - | Vardar Skopje | 0:4 | ||||
| 6. Spieltag | 18.09.2016 | Vardar Skopje | - | FK Rabotnički | 1:0 | |
|||
| 17. Spieltag | 30.11.2016 | FK Pelister | - | Vardar Skopje | 0:1 | ||||
| 18. Spieltag | 04.12.2016 | Vardar Skopje | - | Sileks Kratovo | 1:1 | ||||
| 19. Spieltag | 19.02.2017 | Vardar Skopje | - | KF Shkupi | 3:0 | ||||
| 20. Spieltag | 26.02.2017 | Vardar Skopje | - | KF Shkëndija 79 | 3:1 | ||||
| 21. Spieltag | 05.03.2017 | FK Pobeda Junior | - | Vardar Skopje | 2:1 | |
|||
| 22. Spieltag | 12.03.2017 | Vardar Skopje | - | FK Bregalnica Štip | 2:0 | ||||
| 23. Spieltag | 18.03.2017 | Makedonija GP | - | Vardar Skopje | 0:5 |  |
|||
| 27. Spieltag | 15.04.2017 | Sileks Kratovo | - | Vardar Skopje | 0:1 | |
Armenien