| 1. Spieltag | 20.08.2016 | Balzan FC | - | Mosta FC | 3:2 | ||||
| 2. Spieltag | 26.08.2016 | Mosta FC | - | Valletta FC | 0:1 | ||||
| 3. Spieltag | 10.09.2016 | Hibernians FC | - | Mosta FC | 3:1 |  |
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| 9. Spieltag | 22.10.2016 | Mosta FC | - | Floriana FC | 0:1 | ||||
| 14. Spieltag | 04.12.2016 | Mosta FC | - | Hibernians FC | 0:2 | ||||
| 15. Spieltag | 10.12.2016 | Gżira United | - | Mosta FC | 3:0 | ||||
| 17. Spieltag | 07.01.2017 | St. Andrews FC | - | Mosta FC | 1:1 | |
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| 19. Spieltag | 22.01.2017 | Hamrun Spartans | - | Mosta FC | 3:0 |
Slowakei