| 1. Spieltag | 31.07.2016 | Mushuc Runa | - | LDU Quito | 3:0 |  |
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| 2. Spieltag | 06.08.2016 | Barcelona | - | Mushuc Runa | 3:1 | |
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| 3. Spieltag | 13.08.2016 | Mushuc Runa | - | Deportivo Cuenca | 3:2 | |
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| 4. Spieltag | 21.08.2016 | Aucas | - | Mushuc Runa | 0:1 |  |
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| 7. Spieltag | 10.09.2016 | Club Deportivo River Plate Ecuador | - | Mushuc Runa | 0:0 | |
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| 8. Spieltag | 18.09.2016 | Mushuc Runa | - | Emelec | 3:0 | ||||
| 9. Spieltag | 21.09.2016 | Fuerza Amarilla | - | Mushuc Runa | 1:2 |  |
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| 15. Spieltag | 22.10.2016 | Emelec | - | Mushuc Runa | 3:2 | |
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| 16. Spieltag | 30.10.2016 | Mushuc Runa | - | Club Deportivo River Plate Ecuador | 0:2 | ||||
| 17. Spieltag | 05.11.2016 | Delfín SC | - | Mushuc Runa | 2:1 | ||||
| 18. Spieltag | 12.11.2016 | El Nacional | - | Mushuc Runa | 2:1 | |
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| 19. Spieltag | 20.11.2016 | Mushuc Runa | - | Aucas | 2:0 | |
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| 20. Spieltag | 27.11.2016 | Deportivo Cuenca | - | Mushuc Runa | 3:1 | ||||
| 21. Spieltag | 04.12.2016 | Mushuc Runa | - | Barcelona | 2:4 | |
Ecuador