| 1. Spieltag | 03.08.2024 | FC Rapperswil-Jona | - | FC Basel 1893 II | 5:2 | ||||
| 18. Spieltag | 09.02.2025 | FC Basel 1893 II | - | FC Rapperswil-Jona | 0:3 | ||||
| 19. Spieltag | 15.02.2025 | FC Luzern II | - | FC Basel 1893 II | 2:2 |  |
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| 20. Spieltag | 22.02.2025 | FC Basel 1893 II | - | FC Grand-Saconnex | 2:4 | ||||
| 21. Spieltag | 01.03.2025 | SC Cham | - | FC Basel 1893 II | 1:1 |  |
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| 22. Spieltag | 08.03.2025 | FC Basel 1893 II | - | FC Bavois | 3:1 | |
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| 23. Spieltag | 15.03.2025 | FC Basel 1893 II | - | SC Kriens | 2:1 | |
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| 25. Spieltag | 29.03.2025 | FC Basel 1893 II | - | SR Delémont | 2:0 | |
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| 26. Spieltag | 05.04.2025 | FC Basel 1893 II | - | Vevey-Sports | 1:1 | ||||
| 27. Spieltag | 09.04.2025 | FC Basel 1893 II | - | FC Bulle | 1:1 | |
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| 29. Spieltag | 19.04.2025 | FC Basel 1893 II | - | FC Lugano II | 0:2 | ||||
| 30. Spieltag | 26.04.2025 | FC Basel 1893 II | - | FC Baden | 0:0 | |
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| 31. Spieltag | 03.05.2025 | FC Basel 1893 II | - | FC Breitenrain Bern | 5:1 | |
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| 32. Spieltag | 10.05.2025 | SC Brühl | - | FC Basel 1893 II | 1:3 | |
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| 33. Spieltag | 17.05.2025 | FC Basel 1893 II | - | FC Biel/Bienne | 3:0 | ||||
| 34. Spieltag | 24.05.2025 | FC Zürich II | - | FC Basel 1893 II | 3:0 |
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