| 2. Spieltag | 14.02.2025 | Cusco FC | - | FBC Melgar | 0:1 | ||||
| 3. Spieltag | 24.02.2025 | FBC Melgar | - | Alianza Atlético | 2:1 | ||||
| 5. Spieltag | 09.03.2025 | FBC Melgar | - | Sporting Cristal | 1:0 | ||||
| 6. Spieltag | 27.03.2025 | Ayacucho FC | - | FBC Melgar | 2:3 |  |
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| 7. Spieltag | 05.04.2025 | FBC Melgar | - | AD Tarma | 4:0 | ||||
| 8. Spieltag | 14.04.2025 | Universitario de Deportes | - | FBC Melgar | 4:1 | ||||
| 9. Spieltag | 18.04.2025 | FBC Melgar | - | Deportivo Garcilaso | 1:2 |  |
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| 10. Spieltag | 27.04.2025 | Los Chankas | - | FBC Melgar | 1:1 | ||||
| 11. Spieltag | 02.05.2025 | FBC Melgar | - | Comerciantes Unidos | 1:1 | ||||
| 12. Spieltag | 11.05.2025 | Cienciano | - | FBC Melgar | 1:2 | ||||
| 13. Spieltag | 19.05.2025 | FBC Melgar | - | Atlético Grau | 1:1 | ||||
| 14. Spieltag | 23.05.2025 | Alianza Universidad | - | FBC Melgar | 1:1 | |
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| 15. Spieltag | 14.06.2025 | FBC Melgar | - | Sport Boys | 2:1 | ||||
| 16. Spieltag | 21.06.2025 | Sport Huancayo | - | FBC Melgar | 2:2 | |
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| 17. Spieltag | 29.06.2025 | FBC Melgar | - | Alianza Lima | 0:1 | ||||
| 4. Spieltag | 02.07.2025 | Juan Pablo II College | - | FBC Melgar | 1:1 |
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