| 1. Spieltag | 13.04.2024 | Imbabura [U19] | - | Independiente Juniors [U19] | 0:1 |  |
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| 6. Spieltag | 24.05.2024 | Vinotinto [U19] | - | Independiente Juniors [U19] | 3:4 | ||||
| 7. Spieltag | 01.06.2024 | Independiente Juniors [U19] | - | Manta FC [U19] | 8:0 | |
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| 11. Spieltag | 29.06.2024 | Independiente Juniors [U19] | - | 9 de Octubre [U19] | 4:0 | ||||
| 12. Spieltag | 05.07.2024 | Deportivo Cuenca [U19] | - | Independiente Juniors [U19] | 0:2 | ||||
| 19. Spieltag | 24.08.2024 | Independiente Juniors [U19] | - | Vinotinto [U19] | 3:2 | ||||
| 20. Spieltag | 31.08.2024 | Manta FC [U19] | - | Independiente Juniors [U19] | 0:1 | ||||
| 21. Spieltag | 06.09.2024 | Independiente Juniors [U19] | - | Chacaritas FC [U19] | 7:2 | ||||
| 22. Spieltag | 14.09.2024 | Técnico Universitario [U19] | - | Independiente Juniors [U19] | 0:1 | ||||
| 24. Spieltag | 28.09.2024 | 9 de Octubre [U19] | - | Independiente Juniors [U19] | 4:2 | ||||
| 17. Spieltag | 02.10.2024 | Cumbayá [U19] | - | Independiente Juniors [U19] | 2:3 |  |
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| 25. Spieltag | 05.10.2024 | Independiente Juniors [U19] | - | Deportivo Cuenca [U19] | 0:0 | ||||
| 26. Spieltag | 12.10.2024 | Orense SC [U19] | - | Independiente Juniors [U19] | 0:3 |
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