| 1. Spieltag | 19.01.2025 | Real España | - | Deportivo Génesis | 1:1 | ||||
| 2. Spieltag | 26.01.2025 | Deportivo Génesis | - | Lobos UPNFM | 4:0 |  |
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| 3. Spieltag | 31.01.2025 | Victoria | - | Deportivo Génesis | 1:0 | ||||
| 4. Spieltag | 03.02.2025 | Deportivo Génesis | - | Motagua | 1:1 |  |
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| 7. Spieltag | 18.02.2025 | Deportivo Génesis | - | Marathón | 1:1 | |
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| 8. Spieltag | 23.02.2025 | Juticalpa | - | Deportivo Génesis | 0:1 | ||||
| 9. Spieltag | 03.03.2025 | Deportivo Génesis | - | Olimpia | 1:1 |  |
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| 10. Spieltag | 07.03.2025 | Deportivo Génesis | - | Real España | 2:0 | ||||
| 11. Spieltag | 13.03.2025 | Lobos UPNFM | - | Deportivo Génesis | 1:1 | |
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| 12. Spieltag | 30.03.2025 | Deportivo Génesis | - | Victoria | 3:3 | ||||
| 13. Spieltag | 03.04.2025 | Motagua | - | Deportivo Génesis | 4:1 | |
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| 14. Spieltag | 06.04.2025 | Deportivo Génesis | - | Olancho FC | 3:3 | |
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| 15. Spieltag | 13.04.2025 | Real Sociedad | - | Deportivo Génesis | 1:0 | ||||
| 17. Spieltag | 27.04.2025 | Deportivo Génesis | - | Juticalpa | 1:0 | ||||
| 18. Spieltag | 04.05.2025 | Olimpia | - | Deportivo Génesis | 4:0 |
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