| 1. Spieltag | 02.07.2016 | Águilas Doradas | - | Deportes Tolima | 0:0 |  |
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| 2. Spieltag | 09.07.2016 | Fortaleza FC | - | Águilas Doradas | 2:1 |  |
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| 4. Spieltag | 16.07.2016 | Once Caldas | - | Águilas Doradas | 1:2 | |
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| 5. Spieltag | 23.07.2016 | Águilas Doradas | - | Boyacá Chicó | 2:1 | ||||
| 8. Spieltag | 14.08.2016 | Atlético Junior | - | Águilas Doradas | 1:1 | ||||
| 9. Spieltag | 21.08.2016 | Águilas Doradas | - | Envigado FC | 1:4 | ||||
| 10. Spieltag | 27.08.2016 | Envigado FC | - | Águilas Doradas | 3:1 | |
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| 11. Spieltag | 10.09.2016 | Cortuluá | - | Águilas Doradas | 0:1 | |
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| 12. Spieltag | 15.09.2016 | Águilas Doradas | - | La Equidad | 4:0 | |
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| 13. Spieltag | 18.09.2016 | Atlético Huila | - | Águilas Doradas | 1:2 | |
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| 14. Spieltag | 24.09.2016 | Águilas Doradas | - | Independiente Medellín | 2:2 | |
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| 15. Spieltag | 30.09.2016 | Patriotas FC | - | Águilas Doradas | 0:1 | |
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| 16. Spieltag | 17.10.2016 | Águilas Doradas | - | Santa Fe | 0:4 | ||||
| 17. Spieltag | 23.10.2016 | Deportivo Pasto | - | Águilas Doradas | 0:1 | ||||
| 18. Spieltag | 29.10.2016 | Águilas Doradas | - | Alianza Petrolera | 0:1 | ||||
| 20. Spieltag | 21.11.2016 | Águilas Doradas | - | Deportivo Cali | 1:3 | |
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