| 3. Spieltag | 01.08.2016 | Olimpija Ljubljana | - | NK Krško | 3:1 | ||||
| 5. Spieltag | 14.08.2016 | NK Aluminij | - | NK Krško | 3:0 | ||||
| 6. Spieltag | 21.08.2016 | NK Krško | - | NK Celje | 1:0 | ||||
| 7. Spieltag | 26.08.2016 | NK Radomlje | - | NK Krško | 2:2 | ||||
| 14. Spieltag | 22.10.2016 | NK Krško | - | NK Aluminij | 2:2 |  |
|||
| 15. Spieltag | 29.10.2016 | NK Celje | - | NK Krško | 0:3 | |
|||
| 16. Spieltag | 06.11.2016 | NK Krško | - | NK Radomlje | 1:1 | |
 |
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| 17. Spieltag | 19.11.2016 | NK Krško | - | FC Koper | 0:0 | ||||
| 18. Spieltag | 26.11.2016 | NK Maribor | - | NK Krško | 4:0 | ||||
| 19. Spieltag | 30.11.2016 | Rudar Velenje | - | NK Krško | 2:2 | ||||
| 20. Spieltag | 04.12.2016 | NK Krško | - | NK Domžale | 0:0 | ||||
| 21. Spieltag | 11.12.2016 | Olimpija Ljubljana | - | NK Krško | 1:1 | ||||
| 23. Spieltag | 05.03.2017 | NK Aluminij | - | NK Krško | 1:1 | ||||
| 25. Spieltag | 18.03.2017 | NK Radomlje | - | NK Krško | 0:2 | ||||
| 26. Spieltag | 28.03.2017 | FC Koper | - | NK Krško | 0:2 | ||||
| 27. Spieltag | 01.04.2017 | NK Krško | - | NK Maribor | 1:1 | ||||
| 28. Spieltag | 08.04.2017 | NK Krško | - | Rudar Velenje | 1:2 | ||||
| 30. Spieltag | 23.04.2017 | NK Krško | - | Olimpija Ljubljana | 0:1 | ||||
| 31. Spieltag | 29.04.2017 | ND Gorica | - | NK Krško | 0:0 |
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