| 4. Spieltag | 08.03.2009 | Sporting Cristal | - | Cienciano | 0:2 |  |
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| 5. Spieltag | 15.03.2009 | Cienciano | - | Universidad Cesar Vallejo | 1:1 | |
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| 8. Spieltag | 12.04.2009 | Alianza Lima | - | Cienciano | 2:0 | ||||
| 12. Spieltag | 10.05.2009 | CN Iquitos | - | Cienciano | 1:3 |  |
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| 16. Spieltag | 31.05.2009 | FBC Melgar | - | Cienciano | 2:2 | |
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| 17. Spieltag | 14.06.2009 | Cienciano | - | José Gálvez | 1:0 | ||||
| 18. Spieltag | 21.06.2009 | Universitario de Deportes | - | Cienciano | 2:1 | ||||
| 19. Spieltag | 28.06.2009 | Cienciano | - | Sporting Cristal | 5:5 | ||||
| 20. Spieltag | 05.07.2009 | Universidad Cesar Vallejo | - | Cienciano | 0:1 | ||||
| 21. Spieltag | 12.07.2009 | Cienciano | - | Sport Huancayo | 0:3 | ||||
| 22. Spieltag | 19.07.2009 | Sport Áncash | - | Cienciano | 2:1 | |
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| 29. Spieltag | 23.08.2009 | Inti Gas | - | Cienciano | 0:1 |
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