| 10. Spieltag | 29.10.2016 | Hamrun Spartans | - | Pembroke Athleta FC | 2:1 | ||||
| 11. Spieltag | 05.11.2016 | Mosta FC | - | Pembroke Athleta FC | 0:3 | ||||
| 12. Spieltag | 20.11.2016 | Pembroke Athleta FC | - | Floriana FC | 1:2 |  |
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| 13. Spieltag | 27.11.2016 | Balzan FC | - | Pembroke Athleta FC | 4:0 | ||||
| 14. Spieltag | 03.12.2016 | Pembroke Athleta FC | - | Valletta FC | 0:3 | ||||
| 17. Spieltag | 08.01.2017 | Birkirkara FC | - | Pembroke Athleta FC | 2:0 | ||||
| 18. Spieltag | 14.01.2017 | Pembroke Athleta FC | - | St. Andrews FC | 2:2 | |
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| 19. Spieltag | 22.01.2017 | Tarxien Rainbows | - | Pembroke Athleta FC | 7:1 | ||||
| 20. Spieltag | 28.01.2017 | Pembroke Athleta FC | - | Hamrun Spartans | 1:0 | ||||
| 23. Spieltag | 25.02.2017 | Floriana FC | - | Pembroke Athleta FC | 2:0 |  |
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| 25. Spieltag | 11.03.2017 | Valletta FC | - | Pembroke Athleta FC | 4:0 |
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