| 1. Spieltag | 15.02.2009 | Cienciano | - | FBC Melgar | 2:1 | ||||
| 2. Spieltag | 21.02.2009 | FBC Melgar | - | Total Chalaco | 1:0 |  |
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| 3. Spieltag | 01.03.2009 | Inti Gas | - | FBC Melgar | 1:1 | ||||
| 4. Spieltag | 08.03.2009 | FBC Melgar | - | Alianza Lima | 0:1 | ||||
| 5. Spieltag | 15.03.2009 | Universidad San Martín | - | FBC Melgar | 3:1 | ||||
| 6. Spieltag | 21.03.2009 | FBC Melgar | - | CN Iquitos | 2:1 | |
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| 7. Spieltag | 04.04.2009 | FBC Melgar | - | José Gálvez | 1:0 | |
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| 8. Spieltag | 12.04.2009 | Sport Huancayo | - | FBC Melgar | 2:0 | ||||
| 9. Spieltag | 19.04.2009 | Alianza Atlético | - | FBC Melgar | 1:1 | ||||
| 10. Spieltag | 26.04.2009 | FBC Melgar | - | Sport Áncash | 3:1 | |
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| 11. Spieltag | 03.05.2009 | FBC Melgar | - | Universitario de Deportes | 0:0 | ||||
| 12. Spieltag | 09.05.2009 | Sporting Cristal | - | FBC Melgar | 1:2 | |
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| 18. Spieltag | 21.06.2009 | FBC Melgar | - | Inti Gas | 0:2 |  |
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| 25. Spieltag | 02.08.2009 | Sport Áncash | - | FBC Melgar | 2:2 | ||||
| 26. Spieltag | 09.08.2009 | Universitario de Deportes | - | FBC Melgar | 1:0 | ||||
| 29. Spieltag | 02.09.2009 | Coronel Bolognesi | - | FBC Melgar | 3:2 | |
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