| 17. Spieltag | 14.07.2016 | FK Jonava | - | Kauno Žalgiris | 3:2 | ||||
| 18. Spieltag | 19.07.2016 | FK Jonava | - | FK Atlantas | 1:2 | ||||
| 20. Spieltag | 03.08.2016 | FK Jonava | - | FK Trakai | 1:1 | ||||
| 21. Spieltag | 11.08.2016 | FC Stumbras | - | FK Jonava | 2:1 | ||||
| 22. Spieltag | 17.08.2016 | FK Sūduva | - | FK Jonava | 0:0 | ||||
| 25. Spieltag | 15.09.2016 | FK Atlantas | - | FK Jonava | 0:0 | ||||
| 26. Spieltag | 20.09.2016 | FK Jonava | - | FK Žalgiris | 0:4 | ||||
| 27. Spieltag | 02.10.2016 | FK Trakai | - | FK Jonava | 0:2 | ||||
| 28. Spieltag | 16.10.2016 | FK Jonava | - | FC Stumbras | 1:4 |
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