| 18. Spieltag | 09.02.2025 | FC Basel 1893 II | - | FC Rapperswil-Jona | 0:3 | ||||
| 24. Spieltag | 23.03.2025 | FC Lugano II | - | FC Rapperswil-Jona | 0:2 | ||||
| 25. Spieltag | 29.03.2025 | FC Rapperswil-Jona | - | FC Baden | 1:1 | ||||
| 26. Spieltag | 05.04.2025 | FC Breitenrain Bern | - | FC Rapperswil-Jona | 1:1 | ||||
| 27. Spieltag | 09.04.2025 | FC Rapperswil-Jona | - | SC Brühl | 5:1 |  |
|||
| 28. Spieltag | 13.04.2025 | FC Biel/Bienne | - | FC Rapperswil-Jona | 0:0 | ||||
| 29. Spieltag | 19.04.2025 | FC Rapperswil-Jona | - | FC Zürich II | 3:0 |
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