| 17. Spieltag | 25.11.2012 | Hamburger SV II | - | SV Meppen | 1:2 | ||||
| 18. Spieltag | 30.11.2012 | Hamburger SV II | - | FC Oberneuland | annull. |  |
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| 19. Spieltag | 07.12.2012 | Werder Bremen II | - | Hamburger SV II | 0:1 | ||||
| 24. Spieltag | 03.03.2013 | VfR Neumünster | - | Hamburger SV II | 2:0 | ||||
| 22. Spieltag | 06.03.2013 | Hannover 96 II | - | Hamburger SV II | 4:0 | ||||
| 25. Spieltag | 09.03.2013 | Hamburger SV II | - | BV Cloppenburg | 1:3 |  |
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| 28. Spieltag | 07.04.2013 | Schwarz-Weiß Rehden | - | Hamburger SV II | 4:1 | |
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| 29. Spieltag | 13.04.2013 | Hamburger SV II | - | FC St. Pauli II | 1:2 | ||||
| 31. Spieltag | 27.04.2013 | Hamburger SV II | - | VfL Wolfsburg II | 1:0 | ||||
| 32. Spieltag | 05.05.2013 | Goslarer SC | - | Hamburger SV II | 1:2 | ||||
| 20. Spieltag | 15.05.2013 | Victoria Hamburg | - | Hamburger SV II | 1:3 | ||||
| 27. Spieltag | 19.05.2013 | Hamburger SV II | - | SV Wilhelmshaven | 2:2 |
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