| 21. Spieltag | 14.01.2017 | Arenas de Getxo | - | Rayo Majadahonda | 2:2 | ||||
| 22. Spieltag | 22.01.2017 | Rayo Majadahonda | - | UD Logroñés | 1:0 | ||||
| 24. Spieltag | 05.02.2017 | Rayo Majadahonda | - | CDA Navalcarnero | 0:0 | ||||
| 30. Spieltag | 19.03.2017 | Rayo Majadahonda | - | SD Gernika | 2:0 |  |
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| 31. Spieltag | 25.03.2017 | SD Leioa | - | Rayo Majadahonda | 1:2 |  |
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| 32. Spieltag | 02.04.2017 | Rayo Majadahonda | - | CF Fuenlabrada | 1:1 | ||||
| 33. Spieltag | 09.04.2017 | Albacete | - | Rayo Majadahonda | 0:1 | ||||
| 34. Spieltag | 16.04.2017 | CD Toledo | - | Rayo Majadahonda | 0:1 | ||||
| 36. Spieltag | 29.04.2017 | SD Zamudio | - | Rayo Majadahonda | 1:3 | ||||
| 37. Spieltag | 07.05.2017 | Rayo Majadahonda | - | Athletic Club B | 1:0 | ||||
| 38. Spieltag | 14.05.2017 | Barakaldo CF | - | Rayo Majadahonda | 1:1 |
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