| 1. Spieltag | 25.07.2009 | Servette FC | - | FC Gossau | 2:1 |  |
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| 3. Spieltag | 09.08.2009 | FC Gossau | - | FC Wohlen | 1:3 |  |
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| 4. Spieltag | 14.08.2009 | FC Locarno | - | FC Gossau | 2:2 | |
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| 6. Spieltag | 30.08.2009 | FC Gossau | - | FC Schaffhausen | 1:1 |  |
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| 7. Spieltag | 14.09.2009 | FC Wil 1900 | - | FC Gossau | 4:0 | ||||
| 8. Spieltag | 23.09.2009 | FC Gossau | - | FC Stade Nyonnais | 0:3 | ||||
| 9. Spieltag | 26.09.2009 | FC Lugano | - | FC Gossau | 7:0 | ||||
| 10. Spieltag | 04.10.2009 | FC Gossau | - | Yverdon Sport FC | 1:0 | |
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| 11. Spieltag | 25.10.2009 | FC Biel/Bienne | - | FC Gossau | 8:0 | ||||
| 12. Spieltag | 01.11.2009 | FC Gossau | - | FC Vaduz | 1:4 | ||||
| 13. Spieltag | 08.11.2009 | FC Gossau | - | FC Winterthur | 1:2 | |
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| 15. Spieltag | 05.12.2009 | FC Thun | - | FC Gossau | 4:0 | ||||
| 19. Spieltag | 06.03.2010 | Yverdon Sport FC | - | FC Gossau | 0:1 | |
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| 20. Spieltag | 18.03.2010 | FC Gossau | - | SC Kriens | 2:3 | ||||
| 16. Spieltag | 24.03.2010 | FC Gossau | - | FC Biel/Bienne | 2:2 | |
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| 22. Spieltag | 28.03.2010 | FC Gossau | - | FC Wil 1900 | 1:1 | ||||
| 29. Spieltag | 12.05.2010 | FC Lausanne-Sport | - | FC Gossau | 4:0 |
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