| 1. Spieltag | 03.08.2012 | Goslarer SC | - | Hannover 96 II | 3:3 | ||||
| 2. Spieltag | 10.08.2012 | Holstein Kiel | - | Hannover 96 II | 3:3 |  |
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| 3. Spieltag | 19.08.2012 | SV Meppen | - | Hannover 96 II | 2:4 | ||||
| 4. Spieltag | 25.08.2012 | Hannover 96 II | - | FC Oberneuland | annull. | |
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| 5. Spieltag | 31.08.2012 | Hamburger SV II | - | Hannover 96 II | 0:2 | ||||
| 7. Spieltag | 15.09.2012 | ETSV Weiche Flensburg | - | Hannover 96 II | 1:2 | ||||
| 9. Spieltag | 29.09.2012 | Hannover 96 II | - | TSV Havelse | 0:1 | |
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| 10. Spieltag | 07.10.2012 | VfR Neumünster | - | Hannover 96 II | 3:2 |  |
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| 12. Spieltag | 20.10.2012 | VfB Oldenburg | - | Hannover 96 II | 0:2 | |
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| 8. Spieltag | 25.10.2012 | Hannover 96 II | - | Werder Bremen II | 3:2 | |
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| 14. Spieltag | 03.11.2012 | Schwarz-Weiß Rehden | - | Hannover 96 II | 1:2 | ||||
| 15. Spieltag | 11.11.2012 | Hannover 96 II | - | FC St. Pauli II | 7:0 | ||||
| 16. Spieltag | 18.11.2012 | VfB Lübeck | - | Hannover 96 II | annull. | ||||
| 17. Spieltag | 24.11.2012 | Hannover 96 II | - | VfL Wolfsburg II | 0:0 | ||||
| 18. Spieltag | 01.12.2012 | Hannover 96 II | - | Goslarer SC | 3:2 | ||||
| 19. Spieltag | 10.12.2012 | Hannover 96 II | - | Holstein Kiel | 2:3 |  |
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