| 1. Spieltag | 29.01.2012 | Atlético Junior | - | Deportes Quindío | 1:1 |  |
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| 4. Spieltag | 18.02.2012 | Atlético Junior | - | Deportivo Cali | 1:0 | |
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| 6. Spieltag | 03.03.2012 | Atlético Junior | - | Itagüi Ditaires | 2:1 | ||||
| 7. Spieltag | 11.03.2012 | Patriotas FC | - | Atlético Junior | 2:1 | ||||
| 8. Spieltag | 17.03.2012 | Atlético Junior | - | Boyacá Chicó | 3:1 | ||||
| 9. Spieltag | 25.03.2012 | Atlético Junior | - | Real Cartagena | 3:1 | ||||
| 15. Spieltag | 06.05.2012 | Atlético Junior | - | Cúcuta Deportivo | 4:0 | ||||
| 16. Spieltag | 14.05.2012 | Atlético Nacional | - | Atlético Junior | 3:1 | |
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| 17. Spieltag | 21.05.2012 | Atlético Junior | - | Independiente Medellín | 1:0 | |
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| 18. Spieltag | 27.05.2012 | Once Caldas | - | Atlético Junior | 2:2 |
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