| 1. Spieltag | 11.08.2024 | KF Besa Dobërdoll | - | KF Shkëndija 79 | 1:3 |  |
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| 2. Spieltag | 18.08.2024 | KF Shkëndija 79 | - | FK Rabotnički | 1:1 | ||||
| 4. Spieltag | 31.08.2024 | KF Shkëndija 79 | - | FK Pelister | 2:0 | ||||
| 12. Spieltag | 30.10.2024 | KF Shkëndija 79 | - | KF Besa Dobërdoll | 2:1 | ||||
| 14. Spieltag | 09.11.2024 | KF Shkëndija 79 | - | FK AP Brera Strumica | 4:3 | ||||
| 17. Spieltag | 03.12.2024 | FK Voska Sport | - | KF Shkëndija 79 | 0:1 | ||||
| 22. Spieltag | 05.03.2025 | FC Struga | - | KF Shkëndija 79 | 3:0 | ||||
| 23. Spieltag | 09.03.2025 | KF Shkëndija 79 | - | FK Pelister | 1:0 | ||||
| 25. Spieltag | 31.03.2025 | KF Shkëndija 79 | - | FK AP Brera Strumica | 2:1 | ||||
| 26. Spieltag | 06.04.2025 | GFK Tikvesh | - | KF Shkëndija 79 | 0:1 | ||||
| 27. Spieltag | 13.04.2025 | KF Shkëndija 79 | - | FK Voska Sport | 4:0 | |
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| 28. Spieltag | 19.04.2025 | KF Besa Dobërdoll | - | KF Shkëndija 79 | 2:3 | |
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| 33. Spieltag | 17.05.2025 | KF Shkëndija 79 | - | Sileks Kratovo | 1:3 | |
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