| 1. MFL | 27.08.23 | FK Rabotnički | - | KF Shkëndija 79 | 1:2 | ||||
| 1. MFL | 18.02.24 | Makedonija GP | - | KF Shkëndija 79 | 0:1 | ||||
| 1. MFL | 03.03.24 | KF Shkëndija 79 | - | Vardar Skopje | 3:0 |  |
|||
| 1. MFL | 06.03.24 | FK AP Brera Strumica | - | KF Shkëndija 79 | 0:0 | ||||
| 1. MFL | 12.05.24 | KF Shkëndija 79 | - | FC Struga | 0:2 | ||||
| 1. MFL | 29.09.24 | KF Shkëndija 79 | - | Vardar Skopje | 4:0 | ||||
| 1. MFL | 27.10.24 | KF Shkëndija 79 | - | FC Struga | 1:1 | ||||
| 1. MFL | 31.03.25 | KF Shkëndija 79 | - | FK AP Brera Strumica | 2:1 | ||||
| Kup | 09.04.25 | KF Shkëndija 79 | - | FC Struga | 1:2 | |
|||
| 1. MFL | 19.04.25 | KF Besa Dobërdoll | - | KF Shkëndija 79 | 2:3 | |
Nordmazedonien