| 1. Spieltag | 27.07.2008 | Atlas Guadalajara | - | Jaguares Chiapas | 5:0 |  |
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| 2. Spieltag | 03.08.2008 | Atlas Guadalajara | - | Cruz Azul | 2:4 | |
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| 3. Spieltag | 10.08.2008 | UANL Tigres | - | Atlas Guadalajara | 3:0 | ||||
| 4. Spieltag | 17.08.2008 | Atlas Guadalajara | - | Club San Luis | 0:1 | ||||
| 5. Spieltag | 24.08.2008 | Atlante | - | Atlas Guadalajara | 2:2 | |
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| 6. Spieltag | 28.08.2008 | Atlas Guadalajara | - | CF América | 1:1 | ||||
| 7. Spieltag | 31.08.2008 | Pumas UNAM | - | Atlas Guadalajara | 3:0 | ||||
| 8. Spieltag | 14.09.2008 | Atlas Guadalajara | - | Puebla FC | 2:0 | |
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| 9. Spieltag | 21.09.2008 | Indios Juárez | - | Atlas Guadalajara | 2:4 | |
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| 10. Spieltag | 28.09.2008 | Atlas Guadalajara | - | Deportivo Guadalajara | 0:1 | ||||
| 11. Spieltag | 04.10.2008 | UAG Tecos | - | Atlas Guadalajara | 3:1 | |
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| 13. Spieltag | 19.10.2008 | Club Necaxa | - | Atlas Guadalajara | 0:1 | ||||
| 14. Spieltag | 26.10.2008 | Atlas Guadalajara | - | Santos Laguna | 2:1 | ||||
| 15. Spieltag | 02.11.2008 | Deportivo Toluca | - | Atlas Guadalajara | 4:0 | ||||
| 16. Spieltag | 09.11.2008 | Atlas Guadalajara | - | Monarcas Morelia | 2:1 | ||||
| 17. Spieltag | 16.11.2008 | CF Pachuca | - | Atlas Guadalajara | 1:1 |
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