| 19. Spieltag | 19.02.2017 | FK Pobeda Junior | - | FK Pelister | 2:2 |  |
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| 20. Spieltag | 25.02.2017 | FK Pelister | - | FK Bregalnica Štip | 2:1 | |
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| 21. Spieltag | 05.03.2017 | Makedonija GP | - | FK Pelister | 1:2 | ||||
| 22. Spieltag | 12.03.2017 | FK Pelister | - | FK Rabotnički | 0:1 | ||||
| 23. Spieltag | 18.03.2017 | FK Renova | - | FK Pelister | 2:1 | ||||
| 24. Spieltag | 02.04.2017 | KF Shkupi | - | FK Pelister | 1:0 | |
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| 27. Spieltag | 15.04.2017 | FK Pelister | - | KF Shkëndija 79 | 0:1 | ||||
| 28. Spieltag | 23.04.2017 | FK Pelister | - | FK Pobeda Junior | 1:0 | ||||
| 29. Spieltag | 26.04.2017 | FK Bregalnica Štip | - | FK Pelister | 1:1 | ||||
| 30. Spieltag | 30.04.2017 | FK Pelister | - | Makedonija GP | 3:1 | |
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| 31. Spieltag | 03.05.2017 | FK Rabotnički | - | FK Pelister | 1:1 | ||||
| 32. Spieltag | 07.05.2017 | FK Pelister | - | FK Renova | 3:0 | |
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| 33. Spieltag | 13.05.2017 | FK Pelister | - | KF Shkupi | 1:0 | ||||
| 34. Spieltag | 21.05.2017 | Sileks Kratovo | - | FK Pelister | 3:3 | |
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| 35. Spieltag | 28.05.2017 | FK Pelister | - | Vardar Skopje | 2:3 | |
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| 36. Spieltag | 31.05.2017 | KF Shkëndija 79 | - | FK Pelister | 3:1 | |
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Nordmazedonien