| 11. Spieltag | 16.10.2021 | FC Bavois | - | FC Rapperswil-Jona | 2:1 | ||||
| 13. Spieltag | 30.10.2021 | FC Stade Nyonnais | - | FC Rapperswil-Jona | 1:0 | ||||
| 17. Spieltag | 27.11.2021 | BSC Young Boys II | - | FC Rapperswil-Jona | 5:3 | ||||
| 21. Spieltag | 06.03.2022 | FC Biel/Bienne | - | FC Rapperswil-Jona | 2:1 |  |
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| 22. Spieltag | 12.03.2022 | FC Rapperswil-Jona | - | SC Cham | 1:1 | ||||
| 24. Spieltag | 26.03.2022 | FC Rapperswil-Jona | - | FC Black Stars Basel | 0:0 | |
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| 25. Spieltag | 02.04.2022 | FC Sion II | - | FC Rapperswil-Jona | 0:2 |  |
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| 26. Spieltag | 06.04.2022 | FC Rapperswil-Jona | - | FC Bavois | 0:1 | |
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| 28. Spieltag | 16.04.2022 | FC Rapperswil-Jona | - | FC Stade Nyonnais | 1:1 | ||||
| 29. Spieltag | 23.04.2022 | FC Zürich II | - | FC Rapperswil-Jona | 2:1 | ||||
| 30. Spieltag | 30.04.2022 | FC Rapperswil-Jona | - | AC Bellinzona | 2:2 | |
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