| 1. Spieltag | 03.07.2016 | Patriotas FC | - | Millonarios | 1:0 | ||||
| 2. Spieltag | 10.07.2016 | Millonarios | - | Santa Fe | 1:0 |  |
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| 4. Spieltag | 18.07.2016 | Millonarios | - | Alianza Petrolera | 1:0 | ||||
| 11. Spieltag | 22.07.2016 | Millonarios | - | Once Caldas | 1:1 |  |
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| 5. Spieltag | 24.07.2016 | Jaguares de Córdoba | - | Millonarios | 2:1 | |
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| 6. Spieltag | 31.07.2016 | Millonarios | - | Águilas Doradas | 0:0 | ||||
| 7. Spieltag | 08.08.2016 | Deportes Tolima | - | Millonarios | 3:1 | |
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| 14. Spieltag | 11.08.2016 | Millonarios | - | Atlético Bucaramanga | 0:3 Wert. | |
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| 8. Spieltag | 14.08.2016 | Millonarios | - | Fortaleza FC | 3:2 | ||||
| 13. Spieltag | 18.08.2016 | Millonarios | - | Deportivo Cali | 1:0 | |
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| 9. Spieltag | 22.08.2016 | Atlético Nacional | - | Millonarios | 1:0 | ||||
| 10. Spieltag | 29.08.2016 | Santa Fe | - | Millonarios | 1:2 | ||||
| 12. Spieltag | 15.09.2016 | Boyacá Chicó | - | Millonarios | 0:1 | ||||
| 16. Spieltag | 16.10.2016 | Millonarios | - | Envigado FC | 4:1 | |
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| 18. Spieltag | 31.10.2016 | Millonarios | - | La Equidad | 1:2 | |
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| 15. Spieltag | 04.11.2016 | Atlético Junior | - | Millonarios | 2:1 | ||||
| 20. Spieltag | 21.11.2016 | Millonarios | - | Independiente Medellín | 3:1 |
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