| 9. Spieltag | 21.08.2016 | Deportes Tolima | - | Atlético Junior | 1:1 | ||||
| 1. Spieltag | 08.09.2016 | Atlético Huila | - | Atlético Junior | 3:1 |  |
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| 14. Spieltag | 26.09.2016 | Boyacá Chicó | - | Atlético Junior | 2:2 | |
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| 3. Spieltag | 08.10.2016 | Patriotas FC | - | Atlético Junior | 3:2 | |
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| 16. Spieltag | 16.10.2016 | Atlético Bucaramanga | - | Atlético Junior | 3:0 | ||||
| 17. Spieltag | 23.10.2016 | Deportivo Cali | - | Atlético Junior | 2:0 | ||||
| 18. Spieltag | 30.10.2016 | Atlético Junior | - | Envigado FC | 2:1 | |
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| 15. Spieltag | 04.11.2016 | Atlético Junior | - | Millonarios | 2:1 | ||||
| 19. Spieltag | 06.11.2016 | Cortuluá | - | Atlético Junior | 1:2 | |
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| 20. Spieltag | 20.11.2016 | Atlético Junior | - | La Equidad | 2:1 | |
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