| 1. Spieltag | 12.03.2000 | FC Aarau | - | FC Zürich | 0:0 | ||||
| 2. Spieltag | 18.03.2000 | FC Zürich | - | AC Bellinzona | 4:0 |  |
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| 3. Spieltag | 26.03.2000 | FC Thun | - | FC Zürich | 0:1 | |
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| 5. Spieltag | 08.04.2000 | FC Sion | - | FC Zürich | 1:0 | ||||
| 6. Spieltag | 15.04.2000 | FC Zürich | - | FC Baden | 1:2 |  |
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| 7. Spieltag | 22.04.2000 | FC Lugano | - | FC Zürich | 2:1 | ||||
| 8. Spieltag | 29.04.2000 | FC Zürich | - | FC Lugano | 2:1 | ||||
| 9. Spieltag | 07.05.2000 | FC Baden | - | FC Zürich | 0:1 | ||||
| 10. Spieltag | 14.05.2000 | FC Zürich | - | FC Sion | 2:2 | |
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| 11. Spieltag | 18.05.2000 | SR Delémont | - | FC Zürich | 0:2 | |
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| 13. Spieltag | 04.06.2000 | AC Bellinzona | - | FC Zürich | 0:0 | ||||
| 14. Spieltag | 07.06.2000 | FC Zürich | - | FC Aarau | 1:0 |
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