| 22. Spieltag | 03.03.2013 | NK Domžale | - | FC Koper | 1:1 | ||||
| 23. Spieltag | 10.03.2013 | FC Koper | - | Rudar Velenje | 2:2 | ||||
| 24. Spieltag | 16.03.2013 | ND Gorica | - | FC Koper | 1:1 | ||||
| 27. Spieltag | 06.04.2013 | FC Koper | - | NK Celje | 0:1 | ||||
| 28. Spieltag | 13.04.2013 | FC Koper | - | NK Aluminij | 3:0 | ||||
| 25. Spieltag | 17.04.2013 | FC Koper | - | ND Mura 05 | 3:1 |  |
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| 29. Spieltag | 20.04.2013 | FC Koper | - | NK Maribor | 2:1 | |
 |
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| 31. Spieltag | 08.05.2013 | FC Koper | - | NK Domžale | 3:0 | ||||
| 32. Spieltag | 11.05.2013 | Rudar Velenje | - | FC Koper | 1:4 | ||||
| 33. Spieltag | 14.05.2013 | FC Koper | - | ND Gorica | 2:2 | |
|||
| 34. Spieltag | 18.05.2013 | ND Mura 05 | - | FC Koper | 3:0 | ||||
| 35. Spieltag | 22.05.2013 | FC Koper | - | Olimpija Ljubljana | 0:1 | ||||
| 36. Spieltag | 26.05.2013 | NK Celje | - | FC Koper | 2:2 | |
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