| 20. Spieltag | 12.08.2007 | FK Tom Tomsk | - | FK Amkar Perm | 0:1 |  |
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| 24. Spieltag | 23.09.2007 | Krylia Sovetov | - | FK Tom Tomsk | 1:1 |  |
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| 25. Spieltag | 30.09.2007 | FK Tom Tomsk | - | Kuban Krasnodar (1928-2018) | 2:0 | |
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| 26. Spieltag | 07.10.2007 | Rubin Kazan | - | FK Tom Tomsk | 1:3 | |
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| 27. Spieltag | 20.10.2007 | FK Tom Tomsk | - | CSKA Moskva | 0:1 | ||||
| 29. Spieltag | 03.11.2007 | FK Tom Tomsk | - | FK Khimki | 3:1 | |
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| 30. Spieltag | 11.11.2007 | Spartak Nalchik | - | FK Tom Tomsk | 1:0 |
Nordmazedonien