| 2. Spieltag | 10.07.2016 | Atlético Junior | - | Independiente Medellín | 1:1 | ||||
| 3. Spieltag | 13.07.2016 | Independiente Medellín | - | Envigado FC | 0:1 | ||||
| 4. Spieltag | 17.07.2016 | Cortuluá | - | Independiente Medellín | 3:4 | ||||
| 5. Spieltag | 24.07.2016 | Independiente Medellín | - | La Equidad | 1:0 | ||||
| 6. Spieltag | 01.08.2016 | Independiente Medellín | - | Atlético Huila | 2:1 | ||||
| 7. Spieltag | 08.08.2016 | Deportivo Cali | - | Independiente Medellín | 1:2 | ||||
| 14. Spieltag | 24.09.2016 | Águilas Doradas | - | Independiente Medellín | 2:2 | ||||
| 12. Spieltag | 05.10.2016 | Alianza Petrolera | - | Independiente Medellín | 3:1 | ||||
| 16. Spieltag | 15.10.2016 | Fortaleza FC | - | Independiente Medellín | 2:1 |  |
|||
| 17. Spieltag | 23.10.2016 | Independiente Medellín | - | Atlético Nacional | 2:2 | ||||
| 18. Spieltag | 30.10.2016 | Once Caldas | - | Independiente Medellín | 1:2 | ||||
| 19. Spieltag | 06.11.2016 | Independiente Medellín | - | Boyacá Chicó | 3:2 | ||||
| 20. Spieltag | 21.11.2016 | Millonarios | - | Independiente Medellín | 3:1 |
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