| 8. Spieltag | 10.09.2016 | FC Koper | - | NK Krško | 1:0 | ||||
| 10. Spieltag | 21.09.2016 | FC Koper | - | NK Maribor | 1:2 | ||||
| 11. Spieltag | 25.09.2016 | NK Aluminij | - | FC Koper | 0:0 | ||||
| 14. Spieltag | 22.10.2016 | FC Koper | - | NK Domžale | 1:3 | ||||
| 17. Spieltag | 19.11.2016 | NK Krško | - | FC Koper | 0:0 | ||||
| 18. Spieltag | 26.11.2016 | FC Koper | - | ND Gorica | 0:0 | ||||
| 27. Spieltag | 01.04.2017 | ND Gorica | - | FC Koper | 0:0 | ||||
| 28. Spieltag | 08.04.2017 | FC Koper | - | NK Maribor | 2:2 |  |
|||
| 30. Spieltag | 22.04.2017 | FC Koper | - | Rudar Velenje | 1:0 |  |
|||
| 31. Spieltag | 30.04.2017 | NK Celje | - | FC Koper | 2:2 | ||||
| 35. Spieltag | 21.05.2017 | NK Krško | - | FC Koper | 1:1 |
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