| 1. Spieltag | 08.02.2009 | Independiente Medellín | - | Deportivo Pasto | 1:1 | ||||
| 2. Spieltag | 15.02.2009 | Deportivo Cali | - | Independiente Medellín | 3:1 |  |
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| 5. Spieltag | 01.03.2009 | Independiente Medellín | - | Santa Fe | 2:2 | ||||
| 6. Spieltag | 06.03.2009 | Envigado FC | - | Independiente Medellín | 2:1 | ||||
| 8. Spieltag | 20.03.2009 | Independiente Medellín | - | Deportivo Pereira | 3:0 | ||||
| 9. Spieltag | 22.03.2009 | Atlético Nacional | - | Independiente Medellín | 0:0 | |
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| 11. Spieltag | 12.04.2009 | Independiente Medellín | - | América de Cali | 1:3 | |
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| 12. Spieltag | 19.04.2009 | Atlético Junior | - | Independiente Medellín | 2:1 |  |
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| 14. Spieltag | 30.04.2009 | Deportes Tolima | - | Independiente Medellín | 1:0 | ||||
| 15. Spieltag | 02.05.2009 | Independiente Medellín | - | Millonarios | 1:1 | ||||
| 16. Spieltag | 10.05.2009 | Cúcuta Deportivo | - | Independiente Medellín | 1:0 | ||||
| 17. Spieltag | 14.05.2009 | Independiente Medellín | - | Atlético Nacional | 1:2 | ||||
| 18. Spieltag | 17.05.2009 | Once Caldas | - | Independiente Medellín | 1:0 | |
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