| 1. Runde | 06.08.2003 | Deportivo Pasto | - | Atlético Nacional | 0:0 | ||||
| 1. Runde | 21.08.2003 | Atlético Nacional | - | Deportivo Pasto | 2:1 |  |
|||
| Achtelfinale | 18.09.2003 | LDU Quito | - | Atlético Nacional | 1:1 | ||||
| Achtelfinale | 02.10.2003 | Atlético Nacional | - | LDU Quito | 1:0 | ||||
| Viertelfinale | 22.10.2003 | Boca Juniors | - | Atlético Nacional | 0:1 | ||||
| Viertelfinale | 05.11.2003 | Atlético Nacional | - | Boca Juniors | 4:1 | ||||
| Halbfinale | 13.11.2003 | Atlético Nacional | - | Cienciano | 1:2 |
Kolumbien