| 1. Spieltag | 22.09.2024 | PAOK Saloniki II | - | AEP Iraklis FC | 0:0 |  |
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| 2. Spieltag | 28.09.2024 | PAS Giannina | - | AEP Iraklis FC | 2:1 | ||||
| 3. Spieltag | 05.10.2024 | AEP Iraklis FC | - | AO Kavala | 1:1 | ||||
| 4. Spieltag | 12.10.2024 | AE Lárissa | - | AEP Iraklis FC | 3:0 | ||||
| 6. Spieltag | 25.10.2024 | AEP Iraklis FC | - | Diagoras FC | 1:0 | ||||
| 7. Spieltag | 02.11.2024 | Niki Volou FC | - | AEP Iraklis FC | 1:0 | ||||
| 8. Spieltag | 08.11.2024 | AEP Iraklis FC | - | Makedonikos FC | 3:0 | ||||
| 9. Spieltag | 18.11.2024 | Kampaniakos FC | - | AEP Iraklis FC | 3:3 | |
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| 10. Spieltag | 24.11.2024 | AEP Iraklis FC | - | PAOK Saloniki II | 2:0 | ||||
| 11. Spieltag | 30.11.2024 | AEP Iraklis FC | - | PAS Giannina | 3:1 | ||||
| 12. Spieltag | 08.12.2024 | AO Kavala | - | AEP Iraklis FC | 0:1 | ||||
| 13. Spieltag | 14.12.2024 | AEP Iraklis FC | - | AE Lárissa | 1:2 | ||||
| 14. Spieltag | 20.12.2024 | Ethnikos Neou Keramidiou | - | AEP Iraklis FC | 0:1 | ||||
| 18. Spieltag | 01.02.2025 | AEP Iraklis FC | - | Kampaniakos FC | 5:0 |
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