| 1. Spieltag | 13.07.2009 | Millonarios | - | Atlético Junior | 3:1 |  |
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| 2. Spieltag | 19.07.2009 | Atlético Junior | - | Cúcuta Deportivo | 1:0 | ||||
| 3. Spieltag | 26.07.2009 | Atlético Nacional | - | Atlético Junior | 2:1 |  |
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| 5. Spieltag | 09.08.2009 | Deportivo Pasto | - | Atlético Junior | 1:0 | ||||
| 6. Spieltag | 16.08.2009 | Atlético Junior | - | Deportivo Cali | 5:2 | ||||
| 7. Spieltag | 23.08.2009 | Real Cartagena | - | Atlético Junior | 2:2 | ||||
| 8. Spieltag | 30.08.2009 | Atlético Junior | - | Boyacá Chicó | 5:2 | ||||
| 9. Spieltag | 13.09.2009 | Atlético Junior | - | Real Cartagena | 3:1 |  |
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| 10. Spieltag | 20.09.2009 | Santa Fe | - | Atlético Junior | 2:2 | ||||
| 12. Spieltag | 05.10.2009 | Independiente Medellín | - | Atlético Junior | 1:0 | ||||
| 13. Spieltag | 18.10.2009 | Atlético Junior | - | Deportivo Pereira | 1:1 | |
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| 14. Spieltag | 21.10.2009 | La Equidad | - | Atlético Junior | 1:0 | |
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| 16. Spieltag | 01.11.2009 | Atlético Huila | - | Atlético Junior | 2:1 | ||||
| 17. Spieltag | 08.11.2009 | Deportes Quindío | - | Atlético Junior | 1:0 |
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