| 19. Spieltag | 16.02.2025 | FK Pelister | - | FK AP Brera Strumica | 0:0 | ||||
| 20. Spieltag | 23.02.2025 | GFK Tikvesh | - | FK Pelister | 1:2 | ||||
| 21. Spieltag | 02.03.2025 | KF Shkupi | - | FK Pelister | 3:1 | ||||
| 22. Spieltag | 05.03.2025 | FK Pelister | - | FK Voska Sport | 1:0 | ||||
| 23. Spieltag | 09.03.2025 | KF Shkëndija 79 | - | FK Pelister | 1:0 | ||||
| 24. Spieltag | 15.03.2025 | KF Shkupi | - | FK Pelister | 0:1 | ||||
| 25. Spieltag | 29.03.2025 | FK Pelister | - | Vardar Skopje | 1:3 | ||||
| 27. Spieltag | 13.04.2025 | FK Pelister | - | FK AP Brera Strumica | 1:2 | ||||
| 28. Spieltag | 19.04.2025 | FK Rabotnički | - | FK Pelister | 2:1 | ||||
| 29. Spieltag | 27.04.2025 | FK Pelister | - | GFK Tikvesh | 1:0 | ||||
| 33. Spieltag | 17.05.2025 | FK Pelister | - | KF Besa Dobërdoll | 1:4 |
Japan