| 15. Spieltag | 31.07.2020 | JK Tallinna Kalev | - | FC Flora | 0:3 | ||||
| 16. Spieltag | 07.08.2020 | FC Flora | - | FC Kuressaare | 3:0 | ||||
| 17. Spieltag | 14.08.2020 | JK Tammeka | - | FC Flora | 1:3 | ||||
| 18. Spieltag | 23.08.2020 | Tallinna JK Legion | - | FC Flora | 1:3 | ||||
| 23. Spieltag | 29.08.2020 | FC Flora | - | Tallinna JK Legion | 1:0 | ||||
| 19. Spieltag | 04.10.2020 | FC Flora | - | Tulevik Viljandi | 2:1 | ||||
| 24. Spieltag | 21.10.2020 | JK Narva Trans | - | FC Flora | 1:2 | ||||
| 25. Spieltag | 25.10.2020 | FC Kuressaare | - | FC Flora | 0:4 | ||||
| 21. Spieltag | 28.10.2020 | FC Flora | - | Paide Linnameeskond | 1:0 | ||||
| 26. Spieltag | 01.11.2020 | FC Flora | - | JK Nõmme Kalju | 0:0 | ||||
| 27. Spieltag | 08.11.2020 | JK Tammeka | - | FC Flora | 0:1 |
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